La réunion intervient dans un contexte marqué par le foyer de hantavirus sur un navire de croisière et une flambée d'ébola en République démocratique du Congo et en Ouganda.

L'AMS79 devrait notamment lancer un plan d’action mondial sur le climat et la santé, et maintenir l'élan politique engagé lors de l'AMS78 en vue de la 31e Conférence des Nations unies sur les changements climatiques (COP31), coprésidée par la Turquie et l'Australie.